A facilitação do comércio legítimo é uma tarefa difícil para a administração aduaneira. Os principais desafios que as alfândegas enfrentam para facilitar o comércio de exportação na Etiópia são os seguintes: utilização ineficaz da automatização aduaneira; aplicação inadequada da gestão dos riscos aduaneiros; gestão inadequada dos recursos humanos; coordenação e cooperação ineficazes das alfândegas com as partes interessadas; procedimentos de desalfandegamento complexos; legislação, regras e regulamentos aduaneiros pouco claros.